STR分析(微卫星）
多态性标志STRs，即串联重复序列(simple tandem repeats)，或称简单重复序列（simple sequence repeats, SSR），又称微卫星（microsatellite
16S/18S/ITS等扩增子测序
利用二代高通量测序技术，对微生物的16S rDNA及ITS高变区域，分析环境中的细菌、古细菌以及真菌的种类组成和构成，揭示环境样品中微生物种类以及它们之间的相对丰度、进化关系，进一步探讨微生物多样性。
全基因组重测序（变异位点 遗传进化 基因预测）
全基因组范围内查找个体或群体间DNA水平各种类型的变异，进行遗传进化分析；通过单体型预测，进行全基因组关联分析（GWAS）。