

Edman降解如何实现N端蛋白质测序?步骤与机制解析
产品名称: Edman降解如何实现N端蛋白质测序?步骤与机制解析
英文名称: How Does Edman Sequencing Enable N-Terminal Protein Sequencing? Key Steps and Mechanisms
产品编号: edman-sequencing-zh5
产品价格: 询价
产品产地: 中国北京
品牌商标: 百泰派克生物科技
更新时间: 2025-06-06T09:31:31
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Edman降解如何实现N端蛋白质测序?Edman降解的核心原理是基于N端氨基酸的化学选择性降解,通过环化裂解逐步去除蛋白质N端的氨基酸,并以稳定的衍生物形式进行检测。该方法基于化学反应,利用异硫氰酸苯酯(PITC)特异性地与N端氨基酸结合,通过逐级切除并鉴定多肽链N端的氨基酸,实现N端蛋白质测序。Edman降解其核心步骤分为偶联、裂解、转化与检测,循环重复直至目标序列解析完成。以下为详细步骤及机制解析:
一、Edman降解的详细实验步骤
1、样品准备
(1)蛋白质纯化:确保蛋白样品高纯度,以减少背景噪声。
(2)固定化处理:通常使用玻璃纤维膜或PVDF膜固定样品,以提高降解稳定性。
(3)检查N端封闭情况:确保蛋白质N端没有乙酰化、甲基化等修饰,否则Edman降解无法进行。
2、反应流程
(1)PITC标记:在碱性缓冲液(如三乙胺)中加入PITC,使其与N端氨基结合。
(2)酸性裂解:用三氟乙酸(TFA)促进环化反应,使PTH-氨基酸从肽链中断裂。
(3)有机溶剂萃取:用有机溶剂萃取生成的PTH-氨基酸,以便进行检测。
3、PTH-氨基酸鉴定
采用高效液相色谱(HPLC)进行分离分析。通过与标准PTH-氨基酸对照,确定具体的氨基酸种类。
4、重复循环
清洗反应体系,去除残余PTH-氨基酸。继续降解下一个氨基酸,直至实现完整N端蛋白质测序。
二、Edman降解的机制解析
1、选择性化学反应
PITC能够特异性地与N端氨基酸发生反应,而不会影响蛋白质内部的肽键。
2、温和的降解条件
相比其他化学降解方法(如水解法),Edman降解的条件较温和,避免了蛋白质或多肽的整体破坏。
3、高效的环化裂解
通过酸性环境诱导环化反应,使N端氨基酸高效释放,同时肽链的其余部分保持完整。
4、稳定的PTH-氨基酸分析
PTH-氨基酸具有稳定的光学特性,能够通过HPLC等方法准确检测。
三、Edman降解的优点与局限
1、优点:
(1)高专一性识别N端序列,无需数据库比对
(2)可用于确认蛋白翻译起始位点或标签序列
(3)对于小肽、合成肽、修饰蛋白等提供准确N端结构验证
2、局限:
(1)需高纯度、均一性蛋白样品(杂质影响明显)
(2)无法解析有N端阻断(如乙酰化、修饰)的蛋白
(3)序列过长或样品复杂度高时通量低
(4)对翻译后修饰识别能力有限
Edman降解通过化学反应的精准级联,实现了N端氨基酸的逐级解析。尽管面临通量低、长度受限等挑战,其在短肽测序、N端修饰检测及法规质控中的不可替代性,使其在现代蛋白质科学中仍占有一席之地。未来,与质谱、微流控及人工智能的深度融合,或将为这一经典技术注入新的活力。百泰派克生物科技7大质量控制检测平台,满足您一站式基于Edman降解的蛋白N端序列分析服务需求,致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!
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百泰派克生物科技特色项目
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百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析,提供基于质谱的蛋白测序分析服务,包括对蛋白质的氨基酸组成分析,N端测序,C端测序和全序列分析,以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质,提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务,对蛋白序列进行分析。
※服务优势:
1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;
3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;
4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;
5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug,即可完成检测;
6.测序不受N端封闭,PEC和和糖基化等N端修饰的影响。
二、蛋白质组学
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC,提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务,助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。
※服务优势:
1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析,发现新的生物标记物;
2.体内体外多种蛋白质标记方法,适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;
3.质谱分析灵敏度高,实验结果重复度高;
4.可检测较低丰度蛋白,线性范围广;
5.专业生物信息学分析,分析更系统准确。
三、单细胞质谱流式技术分析
百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析,采用金属元素标记物(通常是金属元素标记的特异抗体)标记细胞表面和内部的分子,然后用流式细胞原理分离单个细胞,再用电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)分析单个细胞的原子质量谱,最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。
※服务优势:
1.技术先进,填补技术空白
采用金属标记抗体技术,避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征,百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。
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单细胞RNAseq受成本等因素限制,所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右,而流式质谱技术一次(单样本)就可分析至少10^5的细胞,实现了数量级的提高,且成本不高于单细胞RNAseq。
3.应用前景大
①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化,在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景;
②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外,质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰;
③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现
百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析,可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究,旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案,深入挖掘未知的靶标。
五、生物药物表征
百泰派克基于高分辨率质谱技术,MALDI TOF,高效色谱分离技术,提供一系列完善的生物药物分析方案,从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析,到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务,帮助生物医药生产商提高生物药物品质。
百泰派克生物科技七大检测平台
百泰派克生物科技-生物制品表征,生物质谱多组学优质服务商
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